浙江医药股份有限公司下属的技术中心，1998年被省经贸委认定为浙江省首批省级企业技术中心，2007年10月被国家发改委等五部委联合授予国家级企业技术中心，2002年被国家人事部授予国家级博士后科研工作站，2012年12月浙江医药企业研究院被浙江省人民*列为重点企业研究院。技术力量雄厚，具有独立承担重大科研项目的研发能力。

公司目前是国内脂溶性维生素、抗耐药抗生素、氟喹诺酮类抗生素产品的主要生产基地之一，在脂溶性维生素及制品、抗耐药抗生素、氟喹诺酮类抗生素以及糖苷酶抑制剂类糖尿病药物等研发、生产及市场开拓上具备一定的优势，有较强的国际竞争力。

公司高度重视原创性研究和具有自主知识产权的技术创新，在维生素产品领域建立了绿色制造和活性成份的微囊化两个技术平台，在药品领域建立了药物粉体工程学和药物合成生物学两个应用研究平台，已搭建起植物内生菌活性物质筛选、天然药物活性成分筛选、“ME-BETTER”新药筛选三个创新药筛选平台。

近年来，为进一步加快新产品的研发和上市步伐，公司加强了与外部制药公司和研发机构的合作。2012年，从台湾太景生物科技股份有限公司及太景生物医药研发（北京）有限公司获得了创新药无氟喹诺酮“苹果酸奈诺沙星”在中国境内的专利独占许可，其口服与注射制剂分别于2016及2020年上市。2013年，与美国AMBRX Inc.签署了《合作开发和许可协议》，双方将合作研发并商业化Her2-ADC产品，该产品是运用革命性技术的新一代单抗偶联物，主要用于乳腺癌适应症，在I期临床中针对其他药物无效的患者表现出相当高的有效率，已经在2019年底进入II-III期临床。

截至2019年末，累计申请国际、国内发明专利563项，其中国际发明专利申请164项，已授权国际、国内发明专利259项。